Организация предлагаемой ООПТ в бассейне р. Комиссаровка позволит существенно улучшить охрану представителей степного флористического комплекса и растительных сообществ с их участием, сохранить богатые реликтами маньчжурской флоры широколиственные, кедрово-широколиственные и хвойные леса в верхнем бассейне реки, а также разнообразный мир животных, связанный с уникальными водными и растительными комплексами.